São José das Palmeiras possui dentro do seu território municipal porções significativas de mata nativa preservada, e com isso, possui uma ARIE – Área de Relevante Interesse Ecológico com um total de 524,54 hectares de mata nativa com o objetivo de contribuir para salvaguardar habitat´s nativos que preservam e mantêm o ecossistema de ocorrência natural de exemplares raros da biota, em especial, da Peroba-rosa, exemplar inserido na lista de espécies ameaçadas de extinção.